利用IBA处理‘豫楸1号’嫩枝,然后分别提取处理后0 天(对照)、1天(激活期)、15天(愈伤形成期)插穗基部的RNA及25天(不定根形成期)和35天(不定根伸长期)根部的RNA进行转录组测序发现:在62,955个 unigenes中,31,646(50.26%)个unigenes获得注释;差异基因分析发现了11,100个差异基因,其中包括10200个特异的和900个共差异的基因;KEGG富集分析显示参与丙烷合成、糖酵解和植物激素代谢等途径的基因对楸树不定根的形成具有重要的作用,并且随着楸树不定根发育进程的发展,参与糖酵解途径的基因数目逐渐减少而参与苯丙素合成的基因数量却在持续增加,表明在IBA刺激后,代谢通路的动态变化响应了不定根的发育进程(图6)。
图6. 楸树差异表达基因的表达谱分析(Wang et al., 2016, Genes and genomics)